At vælge det rigtige område at bo i kan forbedre din rejseoplevelse markant. Selvom Samarkand ikke har tydeligt adskilte bydele som større byer, er der særligt attraktive områder, som er værd at overveje for forskellige typer rejsende.
Det historiske centrum omkring Registan og Gur-e-Amir Mausoleum er ideelt for turister, der ønsker at være tæt på de vigtigste seværdigheder og samtidig nyde stemningen i det gamle Samarkand. Fordelen for familier og solorejsende er nem adgang til museer, restauranter og dagligvarebutikker. Forretningsrejsende kan med fordel vælge hoteller tæt på hovedveje og byens administrative centre, der ofte ligger mod nyere kvarterer nær tog- eller busstationer.
Hvis shopping og lokale markeder er i fokus, er områder nær Siab Bazaar perfekte, hvor den livlige atmosfære og autentiske uzbekiske varer er let tilgængelige. Ulempen kan være mere støj og trafik. Mange hoteller i byen tilbyder transport eller shuttle service, hvilket er praktisk for besøgende, der planlægger at udforske fjernere historiske steder som Shah-i-Zinda complex eller Ulugh Beg Observatory.